Les pilotes sont la base du jeu, une carte correspond à la fois à un pilote et à son F-Zero. Il est impossible de débuter une course tant que chaque joueur n'a pas au moins un pilote.

 Chacun dispose de ses propres caractéristiques qui sont la vitesse, le blindage, le boost, l'adhérence et le poids.

Le niveau de vitesse détermine le nombre de jets de dé que vous faites à votre tour, donc plus vous avez un pilote rapide et plus vous pouvez gagner de place par tour, mais vous avez également plus de chance d'aller droit dans le mur...

La valeur de blindage indique combien de dégâts et de boosts peut supporter le F-Zero avant de rendre l'âme. Les dégâts sont généralement infligés par vos adversaires voulant vous mettre des bâtons dans les propulseurs, et les boosts vous permettent de gagner des places en poussant votre bolide au maximum.

La valeur de boost indique le nombre de places que vous gagnerez immédiatement si vous sacrifiez un point de votre blindage, vous ne pouvez utilisez qu'un boost par tour. La clé de la victoire réside en partie ici : prendre un boost et risquer d'exploser avant la ligne d'arrivée ?

Le poids de votre F-Zero (et du pilote à l'intérieur) s'ajoute à ceux des différentes pièces que vous équiper dessus. La Fédération Intergalactique de F-Zero impose à tous les participants de ne pas dépasser un total de 3000kg. Au départ de chaque course, l'engin le plus léger sera celui qui démarrera le plus rapidement, le joueur qui a le F-Zero le plus léger aura donc le privilège de débuter la course.

Enfin, le niveau d'adhérence est à comparer à la difficulté des circuits. Lorsque votre pilote court sur un tracé dont la difficulté est supérieure à son niveau d'adhérence, il perdra automatiquement une place partour. De plus la valeur de boost sera également réduite de 1. 

La valeur de vitesse est limitée à 3, celles du boost, du blindage et de l'adhérence sont de 5.

En plus de ses caractéristiques, chaque pilote possède une place de départ sur la grille comprise entre 16ième et 30ième, et la plupart des pilotes possèdent également une capacité particulière qui peut avoir des effets très diverses.